霉菌培養箱是培養箱的一種，用于培養霉菌等真核微生物的試驗設備。因為大部分霉菌適合在室溫下生長，且在固體基質上培養時需要保持的濕度，所以一般是由制冷系統，制熱系統，空氣加濕器和培養室，控制電路和操作面板等部分組成，并且是利用溫度傳感器和濕度傳感器來維持培養室內的溫度和濕度的穩定。當然也有一些的霉菌培養箱，可以設定溫度濕度隨培養時間變化。
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